История Контрольно-счетной палаты Мурманской области (далее - Счетная палата) началась в апреле 1997 года, когда Мурманской областной Думой (далее - Дума) был принят Закон Мурманской области от 10.04.1997 года № 56-02-ЗМО "О Контрольно-счетной палате Мурманской области" (далее - Закон) определяющий ее статус (юридическое лицо) и регламентирующий деятельность. Закон был опубликован в газете «Мурманский Вестник» от 30.04.1997 N 82. Однако фактически существовать она начала лишь в декабре 1998 года, когда Постановлением Думы от 15.12.1998 года № 259 была утверждена первая структура и штатная численность Счетной палаты. Эту дату Счетная палата считает своим днем рождения.
Первым Председателем Счетной палаты был назначен Горбунов Виктор Борисович (1998 - 2003 гг.), заместителями Председателя - Гришин Виктор Алексеевич (1998 -2003 гг.), Сухорукова Ирина Васильевна (1998 -2002 гг.).
Первыми аудиторами-инспекторами были Глазырина Т.М. (1999-2004 гг.), Кузьмин А.Н. (1999-2004 гг.), Фанташова О.А. (1999-2004 гг.).
С 01.10.2011 вступил в силу действующий Закон Мурманской области от 17.09.2011 № 1389-01-ЗМО «О Контрольно-счетной палате Мурманской области»
В период 1998-2017 гг. в Законы о Счетной палате вносились изменения, менялась структура.
Председателями Счетной палаты были:
- с 2003 года по 2008 год - Артемов Андрей Николаевич;
- с 2008 года по 2011 год - Агарков Сергей Анатольевич;
- с 2011 года по 2016 год - Лысенков Валерий Федорович;
- с 2016 года по 2021 год - Кашапова Елена Викторовна.
Счетная палата является членом Совета контрольно-счетных органов при Счетной палате Российской Федерации.